Publications

2026

Adam Remaki, Xavier Tannier, Christel Gérardin
LongBEL: Long-Context and Document-Consistent Biomedical Entity Linking (under review at EACL 2027)
Article • Code • Models

Adam Remaki, Christel Gérardin, Eulàlia Farré-Maduell, Martin Krallinger, Xavier Tannier
SynCABEL: Synthetic Contextualized Augmentation for Biomedical Entity Linking
Article • Code • Models • Datasets • Poster

2025

Adam Remaki, Armand Violle, Vikram Natraj, Étienne Guével, Akram Redjdal
LIMICS at ArchEHR-QA 2025: Prompting LLMs Beats Fine-Tuned Embeddings
Article • Poster • Code

Adam Remaki, Jacques Ung, Pierre Pages, Perceval Wajsburt, Elise Liu, Guillaume Faure, Thomas Petit-Jean, Xavier Tannier, Christel Gérardin
Improving Phenotyping of Patients With Immune-Mediated Inflammatory Diseases Through Automated Processing of Discharge Summaries: Multicenter Cohort Study
Article • Poster • Code • Newspaper

Simon Vittoz, Adam Remaki, Thomas Petit jean, Christophe Andre, Gilles Chatellier, Romain Bey, Christel Gérardin
Améliorer l'utilisation des tests biologiques dans l'entrepôt de données de santé de l'AP-HP en développant des pipelines d'analyse automatique pour le contrôle de la qualité des données.
Article

Isabelle Mahé, Yara Skaff, Hélène Helfer, Samuel Benarroch, Florent Happe, Adam Remaki, Kankoe Sallah
Care pathway for patients hospitalized with venous thromboembolism
Article • Code

2024

C. Gerardin, Adam Remaki, J. Ung, P. Pagès, P. Wajsburt, G. Faure, T. Petit-Jean, X. Tannier
Améliorer la caractérisation phénotypique des patients atteints de maladies inflammatoires à médiation immunitaire par l’analyse automatique des comptes-rendus hospitaliers
Article • Code

Solène Delourme, Adam Remaki, Christel Gérardin, Pascal Vaillant, Xavier Tannier, Brigitte Seroussi, Akram Redjdal
LIMICS@DEFT'24 : Un mini-LLM peut-il tricher aux QCM de pharmacie en fouillant dans Wikipédia et NACHOS ?
Article • Code

2023

Adam Remaki, Benoît Playe, Paul Bernard, Simon Vittoz, Matthieu Doutreligne, Gilles Chatelier, Etienne Audureau, Emmanuelle Kempf, Raphaël Porcher, Romain Bey
Adjusting for the progressive digitization of health records: working examples on a multi-hospital clinical data warehouse
Article • Code